醫藥冷庫又稱醫療冷庫，保存在常溫條件下無法保質的各類醫藥產品，在低溫冷藏條件下能使醫藥產品不變質失效，延長保質期。醫用冷庫具體又分：疫苗冷庫、血液冷庫、藥品陰涼庫、生物試劑冷庫等。如圖所示：
疫苗冷庫
疫苗冷庫適宜保存的溫度為-5℃～+8℃左右，與保鮮冷庫的保鮮溫度大致相同，但是疫苗冷庫對溫度和濕度的穩定性要求更高，所以對冷庫安裝公司也提出了更高的要求，一般能夠安裝疫苗冷庫的制冷公司需要具有好幾項資質，這樣才能保安裝出來的疫苗冷庫質量有保障。
疫苗冷庫結構特點：
1)疫苗冷庫的保溫板采用聚氨酯雙面彩鋼板，這種冷庫保溫板的主要效果就是密封性能好，保溫效果良好，還有防潮效果也庫華，確保疫苗冷庫的制冷效果。冷庫門采用電動冷庫門，冷庫管理人員進出的時候可以及時有效的開關門，避免冷庫制冷量流失。
2)疫苗冷庫壓縮機機組一般采用質量有保證的機組，機組運行穩定性強，蒸發器采用的是進口合資的冷凍風冷式蒸發器，能夠有效的滿足冷庫的制冷量，保證冷庫制冷效果，冷庫燈采用的是冷庫LED節能燈，具有抗低溫，能耗低，使用時間長等優點，可以有效的節約疫苗冷庫的運行成本。
3)疫苗冷庫的熱力膨脹閥采用的丹佛斯熱力膨脹閥，質量有保證；由于醫藥冷庫對溫度的要求要高，對溫度的自動控制和調節程度也較高，疫苗冷庫的溫度控制系統采用微電腦全自動控制，不需要專門的人來進行操作，可以遠程遙控，當溫度超出一定范圍時就會自動報警，對疫苗的妥善保存具有重大的意義。
藥品陰涼庫
藥品陰涼庫是控制在20℃以下且太陽不能夠直射到的庫房位置，濕度控制在相對濕度45%～75%，并且對庫房的墻壁、天花、通風、消毒、防疫等都有相應的嚴格要求。制冷控制系統采用全自動微電腦電氣控制技術，無需值守，主要存放西藥，中草藥材，醫療器械，并可監測和記錄儲存區的溫度濕度。
